MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid1

Total Repeats: 589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015319	T	6	6	410	415	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
2	NC_015319	TTA	3	9	434	442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
3	NC_015319	TTTG	2	8	451	458	0 %	75 %	25 %	0 %	327399881
4	NC_015319	AT	4	8	504	511	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
5	NC_015319	A	6	6	556	561	100 %	0 %	0 %	0 %	327399881
6	NC_015319	T	7	7	626	632	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
7	NC_015319	T	6	6	660	665	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
8	NC_015319	ACTATT	2	12	684	695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	327399881
9	NC_015319	TA	3	6	711	716	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
10	NC_015319	TAT	2	6	767	772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
11	NC_015319	TATT	2	8	791	798	25 %	75 %	0 %	0 %	327399881
12	NC_015319	ATT	2	6	813	818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
13	NC_015319	CTT	2	6	833	838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399881
14	NC_015319	ATG	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399881
15	NC_015319	CTA	2	6	925	930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399881
16	NC_015319	CAATT	2	10	937	946	40 %	40 %	0 %	20 %	327399881
17	NC_015319	T	6	6	945	950	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
18	NC_015319	GTGAA	2	10	972	981	40 %	20 %	40 %	0 %	327399881
19	NC_015319	AT	3	6	999	1004	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
20	NC_015319	T	6	6	1045	1050	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
21	NC_015319	AAT	2	6	1057	1062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
22	NC_015319	TTA	2	6	1063	1068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
23	NC_015319	AAATA	2	10	1158	1167	80 %	20 %	0 %	0 %	327399881
24	NC_015319	CCA	2	6	1210	1215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399881
25	NC_015319	TAA	2	6	1217	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
26	NC_015319	AATT	2	8	1227	1234	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
27	NC_015319	AATT	2	8	1239	1246	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
28	NC_015319	AAT	2	6	1251	1256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
29	NC_015319	CTA	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399881
30	NC_015319	T	6	6	1317	1322	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
31	NC_015319	ATTT	2	8	1443	1450	25 %	75 %	0 %	0 %	327399881
32	NC_015319	AAAT	2	8	1470	1477	75 %	25 %	0 %	0 %	327399881
33	NC_015319	GTA	2	6	1496	1501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399881
34	NC_015319	A	8	8	1516	1523	100 %	0 %	0 %	0 %	327399881
35	NC_015319	AT	3	6	1541	1546	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
36	NC_015319	AGA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399881
37	NC_015319	T	7	7	1665	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	327399881
38	NC_015319	ATTT	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	327399881
39	NC_015319	A	7	7	1770	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	327399881
40	NC_015319	TAT	2	6	1815	1820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399881
41	NC_015319	AATT	2	8	1862	1869	50 %	50 %	0 %	0 %	327399881
42	NC_015319	TAA	2	6	1913	1918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399881
43	NC_015319	ATTC	2	8	1920	1927	25 %	50 %	0 %	25 %	327399881
44	NC_015319	TATT	2	8	1954	1961	25 %	75 %	0 %	0 %	327399881
45	NC_015319	AAT	2	6	2019	2024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399882
46	NC_015319	TCT	2	6	2026	2031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399882
47	NC_015319	ACAA	2	8	2201	2208	75 %	0 %	0 %	25 %	327399882
48	NC_015319	A	6	6	2221	2226	100 %	0 %	0 %	0 %	327399882
49	NC_015319	GTCT	2	8	2250	2257	0 %	50 %	25 %	25 %	327399882
50	NC_015319	GAA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399882
51	NC_015319	T	7	7	2315	2321	0 %	100 %	0 %	0 %	327399882
52	NC_015319	ATA	2	6	2332	2337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399882
53	NC_015319	TAAAT	2	10	2410	2419	60 %	40 %	0 %	0 %	327399883
54	NC_015319	TGA	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399883
55	NC_015319	TTG	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399883
56	NC_015319	GTT	3	9	2495	2503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399883
57	NC_015319	T	6	6	2517	2522	0 %	100 %	0 %	0 %	327399883
58	NC_015319	TGA	2	6	2769	2774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399884
59	NC_015319	TG	3	6	2811	2816	0 %	50 %	50 %	0 %	327399884
60	NC_015319	AC	3	6	2866	2871	50 %	0 %	0 %	50 %	327399885
61	NC_015319	A	6	6	2880	2885	100 %	0 %	0 %	0 %	327399885
62	NC_015319	GTA	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399885
63	NC_015319	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399885
64	NC_015319	CAAT	2	8	3191	3198	50 %	25 %	0 %	25 %	327399885
65	NC_015319	GCT	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327399885
66	NC_015319	TAT	2	6	3250	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399885
67	NC_015319	TTC	2	6	3273	3278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399885
68	NC_015319	GAA	2	6	3299	3304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399885
69	NC_015319	TAC	2	6	3335	3340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399885
70	NC_015319	AAG	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399885
71	NC_015319	ATC	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399885
72	NC_015319	A	7	7	3497	3503	100 %	0 %	0 %	0 %	327399885
73	NC_015319	ATT	2	6	3514	3519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399885
74	NC_015319	GAA	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399886
75	NC_015319	GAT	3	9	3926	3934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
76	NC_015319	GAAA	2	8	3937	3944	75 %	0 %	25 %	0 %	327399886
77	NC_015319	AAT	2	6	3994	3999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399886
78	NC_015319	ATG	2	6	4053	4058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
79	NC_015319	ATT	2	6	4077	4082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399886
80	NC_015319	GGAA	2	8	4108	4115	50 %	0 %	50 %	0 %	327399886
81	NC_015319	CTA	2	6	4117	4122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399886
82	NC_015319	A	7	7	4159	4165	100 %	0 %	0 %	0 %	327399886
83	NC_015319	A	6	6	4187	4192	100 %	0 %	0 %	0 %	327399886
84	NC_015319	TG	3	6	4249	4254	0 %	50 %	50 %	0 %	327399886
85	NC_015319	GATG	2	8	4255	4262	25 %	25 %	50 %	0 %	327399886
86	NC_015319	AT	3	6	4324	4329	50 %	50 %	0 %	0 %	327399886
87	NC_015319	CCA	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327399886
88	NC_015319	GAT	2	6	4415	4420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
89	NC_015319	TGA	2	6	4441	4446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
90	NC_015319	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
91	NC_015319	GAT	2	6	4552	4557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399886
92	NC_015319	TGA	2	6	4633	4638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
93	NC_015319	A	7	7	4638	4644	100 %	0 %	0 %	0 %	327399887
94	NC_015319	ATT	3	9	4653	4661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399887
95	NC_015319	A	6	6	4721	4726	100 %	0 %	0 %	0 %	327399887
96	NC_015319	TAC	2	6	4729	4734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399887
97	NC_015319	AT	3	6	4750	4755	50 %	50 %	0 %	0 %	327399887
98	NC_015319	CGA	2	6	4756	4761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399887
99	NC_015319	TGA	2	6	4786	4791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
100	NC_015319	AGA	2	6	4822	4827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399887
101	NC_015319	TGA	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
102	NC_015319	ACTC	2	8	4963	4970	25 %	25 %	0 %	50 %	327399887
103	NC_015319	TTGT	2	8	4975	4982	0 %	75 %	25 %	0 %	327399887
104	NC_015319	TAG	2	6	4992	4997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
105	NC_015319	T	7	7	5017	5023	0 %	100 %	0 %	0 %	327399887
106	NC_015319	AAG	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399887
107	NC_015319	AGG	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327399887
108	NC_015319	GAT	2	6	5087	5092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
109	NC_015319	TGA	2	6	5116	5121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399887
110	NC_015319	GAA	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327399887
111	NC_015319	AAT	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399887
112	NC_015319	ATT	2	6	5424	5429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399888
113	NC_015319	T	6	6	5440	5445	0 %	100 %	0 %	0 %	327399888
114	NC_015319	ATC	3	9	5476	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399888
115	NC_015319	T	6	6	5527	5532	0 %	100 %	0 %	0 %	327399888
116	NC_015319	CTTT	2	8	5534	5541	0 %	75 %	0 %	25 %	327399888
117	NC_015319	GTT	2	6	5682	5687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399889
118	NC_015319	A	7	7	5697	5703	100 %	0 %	0 %	0 %	327399889
119	NC_015319	TCCT	2	8	5712	5719	0 %	50 %	0 %	50 %	327399889
120	NC_015319	CAA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399889
121	NC_015319	ATC	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399889
122	NC_015319	AT	3	6	5798	5803	50 %	50 %	0 %	0 %	327399889
123	NC_015319	ATC	2	6	5818	5823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399889
124	NC_015319	TAC	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399889
125	NC_015319	TAA	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399889
126	NC_015319	CTT	2	6	5946	5951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399890
127	NC_015319	ATC	2	6	5968	5973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399890
128	NC_015319	TCCT	2	8	6010	6017	0 %	50 %	0 %	50 %	327399890
129	NC_015319	ATT	2	6	6032	6037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399890
130	NC_015319	GTT	2	6	6050	6055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399890
131	NC_015319	T	6	6	6086	6091	0 %	100 %	0 %	0 %	327399890
132	NC_015319	TCAT	2	8	6189	6196	25 %	50 %	0 %	25 %	327399891
133	NC_015319	TTA	2	6	6237	6242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327399891
134	NC_015319	T	7	7	6254	6260	0 %	100 %	0 %	0 %	327399891
135	NC_015319	A	6	6	6285	6290	100 %	0 %	0 %	0 %	327399891
136	NC_015319	AATT	2	8	6335	6342	50 %	50 %	0 %	0 %	327399892
137	NC_015319	TAA	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327399892
138	NC_015319	CTT	2	6	6356	6361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399892
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163	NC_015319	TCT	2	6	8718	8723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327399894
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255	NC_015319	TAC	2	6	14638	14643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399901
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259	NC_015319	GT	4	8	14895	14902	0 %	50 %	50 %	0 %	327399901
260	NC_015319	TAC	2	6	14935	14940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399901
261	NC_015319	ATTAC	2	10	15032	15041	40 %	40 %	0 %	20 %	327399901
262	NC_015319	GCA	2	6	15059	15064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327399901
263	NC_015319	TTG	2	6	15073	15078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327399901
264	NC_015319	AAC	2	6	15243	15248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327399902
265	NC_015319	ATG	2	6	15281	15286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327399902
266	NC_015319	ATC	2	6	15297	15302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327399902
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268	NC_015319	ATCG	2	8	15323	15330	25 %	25 %	25 %	25 %	327399902
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